小提琴圖繪制-Graph prism

GraphPad Prism 中為小提琴圖添加顯著性標記(如*P<0.05)的步驟如下:


步驟1:完成統計檢驗

  1. 選擇數據表:確保數據已按分組排列(如A列=Group1,B列=Group2)。
  2. 執行統計檢驗
    • 點擊工具欄 AnalyzeColumn analysesMann-Whitney test(非參數檢驗,適用于非正態數據)
      t-test(若數據符合正態分布)。
    • 在彈出窗口中勾選 Two-tailed(雙尾檢驗)→ 點擊 OK

步驟2:自動添加P值標記

  1. 返回圖形界面,Prism會自動在結果表中生成P值(如P=0.003)。
  2. 手動轉換為星號
    • 雙擊圖形上的P值文本框 → 刪除默認的P值文本。
    • 點擊工具欄 Text toolT圖標)→ 在合適位置添加文本:
      • * 表示 P<0.05
      • ** 表示 P<0.01
      • *** 表示 P<0.001
        (根據實際檢驗結果填寫)

步驟3:添加顯著性連線(可選)

  1. 點擊工具欄 DrawLine,在兩組之間繪制水平線。
  2. 調整線條位置和長度,使其指向分組的中心。
  3. 將星號文本移動到連線上方居中位置。

關鍵設置圖示

  1. 統計檢驗選擇
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  2. 星號標注示例
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注意事項

  1. 檢驗方法選擇

    • 若數據符合正態分布(通過 AnalyzeColumn statisticsNormality test 檢查),使用 非配對t檢驗Unpaired t-test)。
    • 若數據非正態,使用 Mann-Whitney檢驗(非參數檢驗)。
  2. 自動標注插件(Prism 9+):

    • 安裝 Significance Stars 插件(需Prism 9及以上版本):
      ExtensionsAdd Extension → 搜索 Significance Stars → 安裝后一鍵添加星號。
  3. 圖形導出

    • 保存為PDF/TIFF格式(分辨率≥300 dpi)以確保印刷質量。

備選方案:R語言自動標注

如果Prism操作不便,可用R代碼自動生成帶星號的圖形(需原始數據):

library(ggpubr)
ggplot(data, aes(x=Group, y=Value)) +geom_violin() +stat_compare_means(method = "wilcox.test", label = "p.signif",  # 直接顯示星號comparisons = list(c("Group1", "Group2")))

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