在 GraphPad Prism 中為小提琴圖添加顯著性標記(如*P<0.05
)的步驟如下:
步驟1:完成統計檢驗
- 選擇數據表:確保數據已按分組排列(如A列=Group1,B列=Group2)。
- 執行統計檢驗:
- 點擊工具欄
Analyze
→Column analyses
→Mann-Whitney test
(非參數檢驗,適用于非正態數據)
或t-test
(若數據符合正態分布)。 - 在彈出窗口中勾選
Two-tailed
(雙尾檢驗)→ 點擊OK
。
- 點擊工具欄
步驟2:自動添加P值標記
- 返回圖形界面,Prism會自動在結果表中生成P值(如
P=0.003
)。 - 手動轉換為星號:
- 雙擊圖形上的P值文本框 → 刪除默認的P值文本。
- 點擊工具欄
Text tool
(T
圖標)→ 在合適位置添加文本:*
表示P<0.05
**
表示P<0.01
***
表示P<0.001
(根據實際檢驗結果填寫)
步驟3:添加顯著性連線(可選)
- 點擊工具欄
Draw
→Line
,在兩組之間繪制水平線。 - 調整線條位置和長度,使其指向分組的中心。
- 將星號文本移動到連線上方居中位置。
關鍵設置圖示
- 統計檢驗選擇:
- 星號標注示例:
注意事項
-
檢驗方法選擇:
- 若數據符合正態分布(通過
Analyze
→Column statistics
→Normality test
檢查),使用 非配對t檢驗(Unpaired t-test
)。 - 若數據非正態,使用 Mann-Whitney檢驗(非參數檢驗)。
- 若數據符合正態分布(通過
-
自動標注插件(Prism 9+):
- 安裝
Significance Stars
插件(需Prism 9及以上版本):
Extensions
→Add Extension
→ 搜索Significance Stars
→ 安裝后一鍵添加星號。
- 安裝
-
圖形導出:
- 保存為PDF/TIFF格式(分辨率≥300 dpi)以確保印刷質量。
備選方案:R語言自動標注
如果Prism操作不便,可用R代碼自動生成帶星號的圖形(需原始數據):
library(ggpubr)
ggplot(data, aes(x=Group, y=Value)) +geom_violin() +stat_compare_means(method = "wilcox.test", label = "p.signif", # 直接顯示星號comparisons = list(c("Group1", "Group2")))