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文章目錄
- 介紹
- 教程內容
- 數據預處理
- 主成分分析(PCA)
- 聚類分析
- 可視化分析結果
- 提取簇特征
- 教程目的
- 加載R包
- 數據下載
- 導入數據
- 數據預處理
- 主成分分析(PCA)
- 計算相關矩陣
- 繪制相關矩陣熱圖
- 執行PCA
- 可視化PCA結果
- 聚類分析
- 層次聚類
- K均值聚類
- 可視化分析結果
- 繪制PCA變量圖
- 聚類結果可視化
- 提取簇特征
- 總結
- 系統信息
介紹
本教程旨在通過R語言及其相關數據分析包,展示如何對環境數據進行主成分分析(PCA)和聚類分析,并將分析結果進行可視化。教程從數據預處理開始,逐步引導讀者完成PCA分析、聚類分析以及結果的可視化展示。通過本教程,讀者將能夠掌握如何使用R語言對環境數據進行降維處理,提取關鍵信息,并通過聚類分析發現數據中的潛在模式。同時,教程還提供了多種可視化方法,幫助讀者更直觀地理解分析結果。
教程內容
數據預處理
- 讀取數據:使用
read.csv
函數讀取環境數據文件。 - 數據清洗:
- 移除不需要的列(如土壤變量)。
- 將
gen_id
列設置為行名,并移除該列。 - 檢查并移除包含缺失值的行。