Day 1!
前期已經成功挑戰了很多期NHANES啦!打算來試試孟德爾隨機化領域~
隨著孟德爾隨機化研究的普及,現在孟德爾發文的難度越來越高,簡單的雙樣本想被接收更是難上加難,那么如何破除這個困境,這次我打算做組學孟德爾-脂質體組學~
想做的師弟師妹們也可以跟著一起做起來!
挑戰5天完成一篇孟德爾隨機化脂質體組學SCI!
今天的主要任務就是初步檢索+確定目標期刊和文獻。
不同類型文章的操作步驟都類似,首先得檢索你的idea是否已經被他人做過,這特別特別特別重要!!!我對“liposome and mendelian randomization”進行了檢索,截至才發文了12篇,還有挖掘空間!然后我繼續檢索了,“liposome and mendelian randomization and 想做的疾病”,還沒有人寫過,抓緊時間沖鋒!那就這么決定啦~
在看文獻的過程中發現了一篇的經典文章,他所用的方法我都已經掌握,且它所投的期刊的影響因子、發文量、首次回復時間都很不錯,那就以這個期刊和文獻為目標啦!
目標文獻是:Liposomes have a direct effect on multiple myeloma: a Mendelian randomization study
目標期刊是:Front Oncol
讓我們一起快速發文!沖沖沖~
Day 2-3!
挑戰繼續進行~
第2-3天的主要任務:精讀范文+數據下載與整理+開跑代碼
做任何一件事之前都需要有一個總的規劃,不能一上來就盲目開始操作,這樣往往做到一半還是稀里糊涂的!所以在開始跑代碼之前,我又精讀了10篇相關文章,了解需要做出哪些結果、用到哪些方法以后,才開始下載數據!
組學孟德爾的優點在于,它的數據量很大,當你所關注的結局和想做的組學沒人研究過,且有臨床或基礎研究支持時,可以放心大膽的做,很可能可以出陽性結果,這是相比于數據庫而言它的優勢之處!對于科研小白和手上尚沒有文章的醫學生及醫務工作者來說很友好~大家一起瘋狂沖鋒沖鋒~
我們在課程中也推薦了一些好用的科研利器來處理數據,對于不適配的電腦,我們也準備了相關的代碼,可以一鍵處理好外部數據。
數據整理好就可以開始跑代碼啦~準備好相關數據以后,天已經很晚了,讓循環代碼自己跑著就準備去睡覺咯!因為數據量有點多,中途電腦又因為沒電關機了,第二天晚上才跑完結果。
大家一定謹記!跑循環的時候要給電腦插上電哦~
好啦,今天的分享就到這里,一起加油呀~
Day 4!
進度匯報:處理結果+跑出圖表+完成前期寫作
這么快已經到第四天啦!前兩天我已經把數據都跑完了,匯總表格以及結果圖都也已經出來啦~接下來就是根據我們的要求進行數據篩選,然后根據篩選的結果,選出相應的留一法圖、森林圖、散點圖、漏斗圖,并整理在一起就好啦!現在數據要求越來越高了,我設的矯正P值小于0.05,這種篩選標準也比較符合目前審稿人的要求~
根據目標文獻,我還需要根據我的結果做出森林圖以及相關熱圖,拿出準備好的代碼,將數據替換成自己的,就可以完美的跑出結果啦~
今天科室里不忙,結果跑完還有一定的時間富余,那就開始寫作的部分吧~模仿把方法和結果部分寫了,就回去休息咯~
今日份挑戰成功~大家都跟上我們的節奏了嗎~
Day?5!
進度匯報:完成寫作+投稿前準備
昨天已經完成了寫作的方法和結果部分啦!今天剛好是周末,打算一鼓作氣完成剩下的部分!
根據前期的NHANES或者GBD的挑戰,大家會發現我們寫作的時間都不是特別長,因為寫作其實是墜簡單的,根據我們的“框架寫作法”,任何類型的文章都可以拿下!
在寫作前,我已經大量精讀了類似的文章,對整個行文邏輯有了大致的了解后,才開始動的手,今天的任務量還是很重滴!需要完成引言、討論、摘要等部分,然后翻譯、潤色,補充模塊化語句,以及根據目標期刊的投稿要求調整內容!
意料之內~這次也在2天之內寫完了初稿!將所有準備好的內容發給導師看過后,就準備投稿咯!
光速完成一篇脂質體組學孟德爾隨機化,挑戰成功!!!