文章一
文章信息
APOE ε4 influences within and between network functional connectivity in posterior cortical atrophy and logopenic progressive aphasia
2024美國梅奧診所發表在Alzheimers Dement.?的文章。
“APOE ε4等位基因對后皮質萎縮與進行性語言障礙型失語癥的網絡內及網絡間功能連接的影響”
fMRI方法
Image acquisition
3T volumetric MRI。獲取睜眼靜息狀態的fMRI。
Image processing
1）預處理_CONN functional connectivity toolbox，鏈接www.nitrc.org/projects/conn.
具體包括：
棄用前10個時間點以獲取穩態磁化強度；
切面時間校正、重新對齊（運動估計與校正）、異常值檢測；
分割同時標準化至MNI模板空間；
使用6毫米半高全寬的高斯核作平滑處理；
對白質和腦脊液進行偽影回歸；
基于6個頭動參數及其1階、2階導數完成去噪；
帶通濾波器過濾0.01-0.1Hz頻帶以外的信號以降低低頻偏移和噪聲影響。
2）分區_皮層和皮層下腦區。借助：Harvard-Oxford atlas和CONN‘s network parcellations atlas。方法：Independant Component Analysis（ICA推斷的獨立成分包含頭動噪聲、血管搏動噪聲、掃描儀噪聲等，需要結合鬧網絡模板進行篩選）。
3）信號分析_BOLD。
具體包括：
各ROI的平均BOLD時間序列提取；
在ROI間作Pearson’s R correlation coefficients計算、Fisher‘s R-to-Z轉換。
文章二
文章信息
Hippocampal connectivity and memory decline in cognitively intact APOE ε4 carriers
2023美國梅奧診所分所發表在Alzheimers Dement.?的文章。
“認知功能完整的APOE ε4攜帶者的海馬連接性與記憶減退”
fMRI方法
Image acquisition
3T. Resting-state（eyes open）BOLD。同時獲取高分辨T1結構相，用于計算部分結構的體積。
Image processing
1）預處理
基于圖論分析的連接分析用CONN toolbox version 19.b實現（RRID:SCR_009550 www.nitrc.org/projects/conn）。
 一棵 AVL 樹)
