使用機器學習做醫學圖像分類的開源項目集錦

項目名稱倉庫描述主要特點適配建議
U-Net用于生物醫學圖像分割zhixuhao/unetKeras中的U-Net實現,用于2D圖像分割。

- 基本的U-Net架構

- 生物醫學圖像訓練示例

- 簡單的數據加載器

- 修改數據加載器以處理特定MRI格式

- 調整訓練管道以適應STIR序列和標簽

使用PyTorch進行醫學圖像分割milesial/Pytorch-UNetPyTorch中的U-Net實現,設計靈活,易于使用。

- PyTorch實現的U-Net

- 訓練和驗證管道

- 分割結果的可視化工具

- 定制數據預處理管道以適應MRI圖像

- 實現醫學圖像的增強策略

用于醫學成像的深度學習框架Project-MONAI/MONAINVIDIA和倫敦國王學院開發的全面框架。

- 廣泛的數據處理工具

- 預定義的網絡和損失函數

- 示例工作流程

- 使用數據處理工具簡化預處理步驟

- 利用現有網絡架構并微調

使用深度學習進行MRI分割ellisdg/3DUnetCNN專為體積醫學圖像分割設計的3D U-Net實現。

- 3D U-Net架構

- 訓練和評估示例腳本

- 處理3D醫學成像格式的工具

- 適配3D U-Net模型處理STIR MRI序列

- 實現預處理步驟以處理3D數據和增強

自動化醫學圖像分割MIC-DKFZ/nnUNet自適應框架,提供開箱即用的最先進性能。

- 自動配置

- 廣泛的預處理和增強策略

- 支持多種網絡架構

- 利用自動配置功能適應數據集

- 在STIR MRI序列上訓練模型并優化配置

為了進一步推進這些項目

  1. 數據準備: 確保你的MRI數據格式正確并已標注。
  2. 環境設置: 設置包含必要庫(TensorFlow、PyTorch、MONAI等)的Python環境。
  3. 模型訓練: 使用提供的訓練腳本,適應你的數據和特定任務需求。
  4. 評估和微調: 在驗證集上評估模型性能,并根據需要調整超參數和模型架構。
  5. 協作: 與醫學專業人員合作,驗證模型輸出的臨床相關性,確保符合醫學標準。

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