Linux使用circos

1.在conda中安裝bioconda

conda install -c bioconda circos -y
# 測試是否所有的module都安裝好了
circos -module
# 所有都顯示OK則成功
ok       0.39 Font::TTF::Font
ok       2.68 GD
ok       0.2 GD::Polyline
...      ....

2.檢查模塊是否齊全 circos -module

3.下載

wget http://www.circos.ca/distribution/circos-0.69-9.tgz
tar -zvxf circos-0.69-9.tgz

4.測試

可以用自帶的例子測試一下?

cd circos-0.69-9/example/
../bin/circos -conf etc/circos.conf

運行成功之后,會在當前目錄生成circos.png和circos.svg兩張圖片。

參考:?生信 | Circos的安裝 - 簡書 (jianshu.com)

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