綜述 2017-Genome Biology：Alignment-free sequence comparison

Zielezinski, Andrzej, et al. "Alignment-free sequence comparison: benefits, applications, and tools."?Genome biology?18 (2017): 1-17.?https://genomebiology.biomedcentral.com/articles/10.1186/s13059-017-1319-7

  • 被引次數：476
  • 應用問題：全基因組系統發育、蛋白質家族分類、水平轉移基因鑒定、重組序列檢測

一、基于詞頻方法

圖1

二、基于信息論

圖2

三、Alignment-free sequence comparison tools for NGS data

當前可用程序的最新列表可以在 http://www.combio.pl/alfree/tools/ 上找到。訪問日期：2017 年 8 月 23 日

四、Alignment-free sequence comparison tools for 研究目的

表格 link：Alignment-free sequence comparison: benefits, applications, and tools | Genome Biology | Full Text

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