python 數據分析 單細胞測序數據分析 相關的圖表,常見于腫瘤免疫微環境、細胞亞群功能研究 ,各圖表類型及邏輯關系如下

這是一組 單細胞測序數據分析 相關的圖表,常見于腫瘤免疫微環境、細胞亞群功能研究 ,各圖表類型及邏輯關系如下:

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圖表類型

  1. A、E(堆疊柱狀圖)
    • 展示不同分組(如 SLC7A1 Low/High )下,各類細胞亞群(T cells、Macrophage 等)的占比分布,用于對比分組間細胞組成差異。
  2. B(單細胞聚類降維圖,如 UMAP/t-SNE)
    • 呈現單細胞數據降維聚類結果,不同顏色代表細胞亞群(如 TAMs、DCs 等),輔助識別細胞群體分類。
  3. C(單細胞特征分布散點圖)
    • 用散點分布展示特定基因(如 CD1C、S100A8 )在單細胞聚類中的表達模式,輔助標注細胞亞群功能。
  4. D(點圖/氣泡圖)
    • 橫軸為細胞亞群,縱軸為基因/通路,點的大小、顏色代表基因表達或通路活性,用于對比亞群間分子特征差異。
  5. F(富集分析柱狀圖)
    • 展示 KEGG 通路富集結果 ,按通路得分排序,突出分組(SLC7A1 高低表達)間顯著差異的功能通路。
  6. G、H、I、K(細胞通訊分析圖,如熱圖、網絡、弦圖)
    • G(熱圖) :展示不同細胞亞群間通訊 “連接數” 或 “強度”;
    • H(網絡/弦圖) :可視化細胞亞群間配體 - 受體互作關系;
    • I(差異通訊熱圖) :對比分組間細胞通訊差異;整體用于解析細胞間信號互作模式。
  7. J(差異基因/通路條形圖)
    • 按差異程度排序,展示分組間顯著變化的基因或通路,輔助篩選關鍵調控分子。
  8. L(信息流向分析圖)
    • 用 “輻射狀/流量圖” 呈現信號通路、細胞亞群間的信息傳遞方向與強度,整合功能與通訊分析結果。

邏輯關系

“細胞分群 → 分子特征 → 功能差異 → 細胞通訊” 的遞進分析:

  1. 基礎分群(B、A、E) :先通過降維聚類(B)確定細胞亞群,再用堆疊柱圖(A、E)對比分組(SLC7A1 高低)的細胞組成差異,明確研究對象的群體結構。
  2. 分子特征(C、D、F) :基于分群結果,用散點圖(C)標注亞群特征基因,點圖(D)分析亞群內基因/通路活性,柱狀圖(F)做功能富集,解析亞群分子功能差異。
  3. 細胞通訊(G、H、I、K、L) :從分子功能延伸到 “細胞間互作”,用熱圖、網絡、弦圖等(G - L)分析不同亞群間配體 - 受體信號傳遞,挖掘群體間調控關系,最終整合功能與通訊結果,解釋生物學機制(如腫瘤微環境中免疫細胞互作)。

簡單說:先 “分群看組成”,再 “看分子找功能”,最后 “看通訊理調控” ,層層遞進解析單細胞數據背后的細胞群體特征與互作規律。

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