Singularity 安裝

Singularity 是什么?

  • 核心功能:用于創建/運行容器(將應用+依賴打包的獨立環境)。

  • 與 Docker 的區別:專為 HPC(高性能計算)設計,無需后臺守護進程,支持非 root 運行容器(但安裝本身需 root 權限)。

      適用于在具有 root 權限的計算機上從源代碼安裝 Singularity。其他安裝選項(如構建 RPM 包、非 root 權限安裝)請參閱《管理員指南》的“安裝”部分。
若需在共享資源上請求安裝,請參考“請求安裝”部分聯系系統管理員。

官網:Documentation | Apptainer - Portable, Reproducible Containers

Singularity于Docker區別

       在 HPC 環境中,Docker 因依賴需 root 權限的 dockerd 守護進程,與 Slurm 等調度器的 cgroups 資源分配機制沖突,且數據卷掛載存在越權訪問風險。而 Singularity 支持普通用戶直接啟動容器,進程可被 Slurm 當作普通進程管理,能嚴格隔離容器訪問范圍,還原生集成 MPI 等高性能通信庫,與調度器無縫協作,其單一.sif 鏡像文件更便于在并行文件系統中傳輸共享,避免 Docker 分層鏡像的存儲開銷,更適配 HPC 環境需求。

Singularity與 Docker 的應用場景對比

場景Docker 更適合Singularity 更適合
開發測試快速迭代、微服務架構HPC 集群、科學計算
權限要求開發環境(可接受 root 權限)多租戶 HPC、共享服務器
鏡像分發云原生應用(Kubernetes)并行文件系統(Lustre/GPFS)
資源隔離細粒度 CPU / 內存限制與 Slurm 等調度器深度集成

Docker 與 Singularity 在 HPC 環境的核心對比

問題領域Docker 的缺陷Singularity 的解決方案HPC 場景影響
權限模型依賴 root 權限的守護進程 (dockerd),普通用戶需 sudo 提權操作。無守護進程:普通用戶直接運行容器,進程身份繼承用戶權限(UID/GID 映射),禁止容器內提權? 消除安全風險,符合多租戶隔離要求。
資源隔離dockerd 與 Slurm/PBS 的 cgroups 資源分配沖突,無法被調度器直接管理。與調度器原生協同:容器進程作為普通進程被調度器管控,直接復用 Slurm 的 cgroups 資源限制? 實現精確資源分配,避免干擾其他任務。
數據安全掛載卷時可能暴露主機敏感路徑(如 //etc),容器內 root 可越權訪問。安全沙盒機制
1. 默認隔離主機系統路徑;
2. 掛載卷時強制權限映射(用戶僅訪問授權目錄)。
? 杜絕越權訪問,滿足審計與合規要求。
高性能計算支持需復雜配置支持 GPU/NIC 直通、MPI 庫兼容性差(如 Docker 容器間 RDMA 通信困難)。原生高性能支持
1. 無縫集成 GPU(--nv)、RDMA(--ib);
2

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