腦機新手指南(二十一)基于 Brainstorm 的 MEG/EEG 數據分析(上篇)

一、腦機接口與神經電生理技術概述?

腦機接口(Brain-Computer Interface, BCI)是一種在大腦與外部設備之間建立直接通信通道的技術,它通過采集和分析大腦信號來實現對設備的控制或信息的輸出。神經電生理信號作為腦機接口的重要數據來源,主要包括以下幾種類型:

MEG(腦磁圖):通過測量大腦神經元電活動產生的磁場變化來反映腦功能,具有極高的時間分辨率。

EEG(腦電圖):通過頭皮電極記錄大腦皮層的電活動,設備便攜、成本較低,是研究腦電活動的常用手段。

fNIRS(功能近紅外光譜):利用近紅外光檢測大腦皮層的血氧變化,可反映腦區的神經活動。

ECoG(皮層腦電圖) 和 深度電極記錄:通過植入顱內的電極直接記錄大腦皮層或深層結構的電活動,信號質量高,常用于臨床研究。?

二、Brainstorm?軟件:腦電數據分析的利器?

(一)軟件簡介與優勢?

Brainstorm?是一款專為腦電信號分析設計的開源軟件,具有以下顯著優勢:

多模態支持:可對?MEG、EEG、fNIRS、ECoG?等多種類型的腦電信號進行分析。?

用戶友好:擁有直觀的圖形界面,無需編程知識即可操作,非常適合初學者。

功能強大:涵蓋數據預處理、可視化、源定位、功能連接分析等完整的數據分析流程。

無需?Matlab?許可證:盡管基于?Matlab?和?Java?開發,但提供獨立可執行版本,支持?Windows、MacOS、Linux?等多種操作系統。?

(二)軟件下載與安裝?

下載步驟

打開瀏覽器,訪問?Brainstorm?官方網站:Introduction - Brainstorm。

在首頁找到?“Download”?或類似下載鏈接,點擊進入下載頁面。?

根據自己的操作系統(Windows、MacOS?或?Linux)選擇相應的安裝包進行下載。?

安裝指南

下載完成后,雙擊安裝包,按照提示進行安裝。

安裝過程中,可選擇默認安裝路徑或自定義安裝位置。

安裝完成后,桌面上會生成?Brainstorm?的快捷方式,雙擊即可啟動軟件。?

(三)軟件界面與基本操作?

界面組成

菜單欄:包含文件、編輯、查看、工具等多個菜單,提供各種功能選項。

工具欄:放置常用功能的快捷按鈕,方便快速操作。

項目管理器:用于管理實驗項目、受試者數據和分析流程。

數據顯示區:顯示腦電信號的波形、頻譜等信息。

日志窗口:記錄軟件操作的日志信息,便于排查問題。

基本操作流程

啟動軟件后,首先需要創建一個新項目,用于組織和管理數據。

在項目管理器中,添加受試者信息和實驗條件。

導入腦電數據,Brainstorm?支持多種文件格式,如?EEGLab?的.set?文件、Neuroscan?的.cnt?文件等。?

通過菜單欄和工具欄中的功能按鈕,對數據進行預處理、分析和可視化。

三、腦電數據預處理:從原始信號到可用數據?

(一)數據導入與格式轉換?

導入本地數據

點擊菜單欄中的?“File”→“Import”→“Data”,選擇要導入的數據文件。?

在彈出的對話框中,根據數據格式選擇相應的導入選項。

導入完成后,數據會顯示在項目管理器中。

格式轉換

如果導入的數據格式不是?Brainstorm?常用的格式,可通過?“File”→“Convert”→“Data Format”?進行轉換。?

選擇源格式和目標格式,設置相關參數,點擊?“Convert”?即可完成轉換。?

(二)數據檢查與可視化?

波形查看

在項目管理器中選中導入的數據,點擊工具欄中的?“View Time Series”?按鈕,查看腦電信號的波形。?

通過調整時間窗口和通道選擇,觀察信號的整體特征和異常情況。

頻譜分析

點擊?“Tools”→“Spectral Analysis”→“Power Spectrum Density”,對腦電信號進行頻譜分析。

可選擇不同的頻率范圍和分析方法,查看信號的功率譜密度分布。

(三)偽跡去除與數據清洗?

眼電和心電偽跡檢測

Brainstorm?提供了自動檢測眼電和心電偽跡的功能。點擊?“Tools”→“Artifact Detection”→“Eye Blinks”?或?“Heartbeats”,軟件會自動識別并標記偽跡。

對于自動檢測不準確的偽跡,可通過手動方式進行調整和標記。

獨立成分分析(ICA)去偽跡

ICA?是一種常用的偽跡去除方法,可將腦電信號分解為多個獨立成分。點擊?“Tools”→“Artifact Correction”→“Independent Component Analysis (ICA)”,進行?ICA?分解。?

通過觀察各獨立成分的時空特征,識別并去除與偽跡相關的成分。

壞通道和壞試次檢測

點擊?“Tools”→“Artifact Detection”→“Bad Channels”?或?“Bad Trials”,檢測并標記壞通道和壞試次。?

對于壞通道,可采用插值法進行修復;對于壞試次,可選擇刪除或進行其他處理。

(四)基線校正與數據分段?

基線校正

基線校正用于消除信號中的直流偏移和低頻漂移。點擊?“Tools”→“Preprocessing”→“Baseline Correction”,設置基線時間段和校正方法。?

一般選擇刺激前的一段時間作為基線,通過減去基線均值來實現校正。

數據分段(Epoch)

數據分段是將連續的腦電信號劃分為多個時間窗口(Epoch),以便進行后續的統計分析。點擊?“Tools”→“Preprocessing”→“Epoch”,設置分段的時間范圍和事件標記。?

分段完成后,可對每個?Epoch?進行平均,得到事件相關電位(ERP)。?

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