以下是重疊和非重疊上游開放閱讀框(uORFs)對翻譯效率影響的總結:
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重疊uORFs:
- 重疊uORFs對主要編碼區的翻譯影響更為顯著,因為它們直接與下游編碼序列(CDSs)競爭核糖體結合。
- 重疊uORFs的翻譯起始信號通常低于非重疊uORFs。這可以通過重疊uORFs相對于非重疊uORFs較低的相對翻譯起始水平來證明。
- 重疊uORFs中,ATG起始的uORFs較少,且它們的Kozak序列得分(反映起始密碼子的周圍序列環境)較低。
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非重疊uORFs:
- 非重疊uORFs對下游CDS的翻譯抑制作用較小,因為它們不直接與主要CDS競爭核糖體結合。
- 非重疊uORFs的翻譯起始信號相對較高,這表明它們在調控翻譯起始方面可能更為有效。
- ATG起始的非重疊uORFs具有更高的Kozak序列得分,表明其翻譯起始效率較高。
總體而言,重疊uORFs由于與下游CDS的競爭,往往對翻譯效率有更顯著的抑制作用,而非重疊uORFs的影響則相對較小,且其翻譯起始效率通常較高。
參考文獻:
2023_Annotation of uORFs in the OMIM genes allows to reveal pathogenic variants in 5’UTRs