之前講過臨床模型預測的專欄，但那只是基礎版本，下面我們以自噬相關基因為例子，模仿一篇五分文章，將圖和代碼復現出來，學會本專欄課程，可以具備發一篇五分左右文章的水平：

本專欄目錄如下：

Figure 1：差異表達基因及預后基因篩選(圖片僅供參考) 

Figure 2. 生存分析，箱線圖表達改變分析（圖片僅供參考）

Figure 3. 基因富集分析（圖片僅供參考） 

Figure 4.構建臨床預測模型（圖片僅供參考）

Figure 5.訓練集訓練模型（圖片僅供參考）

Figure 6.測試集測試模型（圖片僅供參考） 

Figure 7.外部數據集驗證模型（圖片僅供參考）

Figure 8.生存曲線魯棒性分析（圖片僅供參考）

FIgure 9.列線圖構建，ROC分析，DCA分析（圖片僅供參考）

Figure 10.機制及腫瘤免疫浸潤（圖片僅供參考）

下面分析機制，機制分析有多種方法，GSVA、GSEA和普通的富集方法（DAVID富集）等。

下面對之前計算的評分進行熱圖繪制：

主要用到的數據是上面一期的通路活性評分數據，和做列線圖的數據：