數據組合與合并:Pandas 數據整合全指南 +缺失值處理

數據組合與合并:Pandas 數據整合全指南

在進行數據分析之前,數據清洗與整合是關鍵步驟。

遵循“整潔數據”(Tidy Data)原則:

  • 每個觀測值占一行
  • 每個變量占一列
  • 每種觀測單元構成一張獨立的表格

整理好數據后,常常需要將多個數據集組合起來,才能回答復雜問題。


一、連接數據(Concatenation)

當多個數據集結構相似(列名一致或相近),可以使用 pd.concat() 將它們按行或列方向拼接。

1. 添加行:DataFrame 連接

import pandas as pd# 加載多個結構相似的 CSV 文件
df1 = pd.read_csv('data/demo1.csv')
df2 = pd.read_csv('data/demo2.csv')
df3 = pd.read_csv('data/demo3.csv')# 沿行方向(垂直)連接
row_concat = pd.concat([df1, df2, df3], ignore_index=True)  # 重置索引
print(row_concat)

參數說明:

  • ignore_index=True:重新生成從 0 開始的整數索引,避免重復行標簽。
  • 默認 axis=0 表示按行連接(上下拼接)。

2. 添加行:DataFrame 與 Series 連接

df1 = pd.read_csv('data/demo1.csv')
new_series = pd.Series(['n1', 'n2', 'n3', 'n4'], index=['A', 'B', 'C', 'D'])  # 推薦指定索引# 錯誤方式(不推薦):
# pd.concat([df1, new_series])  # Series 被當作新列添加,造成 NaN 填充# 正確方式:將 Series 轉為 DataFrame 再連接
new_row_df = pd.DataFrame([new_series], index=['new_row'])  # 包裝成一行的 DataFrame
result = pd.concat([df1, new_row_df], ignore_index=False)

關鍵點:

  • 直接 concat([df, series]) 會嘗試按列對齊,導致 Series 成為新列,原數據缺失處填 NaN
  • 應先將 Series 轉換為單行 DataFrame,并確保其 index 與目標 DataFrame 的列名匹配。

3. 添加行:使用 append() 方法(已棄用,建議用 concat)

注意:DataFrame.append() 方法在 Pandas 1.4+ 中已被 棄用(deprecated),官方推薦使用 pd.concat() 替代。

舊寫法(不推薦):

# 已棄用
new_row = {'A': 'n1', 'B': 'n2', 'C': 'n3', 'D': 'n4'}
df1 = df1.append(new_row, ignore_index=True)

新寫法(推薦):

new_row_df = pd.DataFrame([{'A': 'n1', 'B': 'n2', 'C': 'n3', 'D': 'n4'}])
df1 = pd.concat([df1, new_row_df], ignore_index=True)

4. 添加行:重置索引

當多次連接后,行索引可能出現重復或無序:

result = pd.concat([df1, df2, df3])
result = result.reset_index(drop=True)  # 丟棄原索引,生成新整數索引

建議:在垂直連接時始終使用 ignore_index=True 或后續調用 reset_index(drop=True)


5. 添加列:使用 concat()

水平連接(axis=1)可實現列拼接:

col_concat = pd.concat([df1, df2], axis=1)  # 按列拼接(左右)

注意:

  • 默認按行索引對齊,若索引不一致會導致 NaN
  • 若兩個 DataFrame 行數不同但索引相同,也能對齊。

6. 添加列:直接賦值(最常用)

# 添加標量(廣播)
df1['new_col'] = 0# 添加列表或數組(長度需匹配)
df1['new_col'] = [1, 2, 3, 4]# 添加 Series(按索引自動對齊)
s = pd.Series([10, 20, 30, 40], index=df1.index)
df1['new_col'] = s

這是最簡潔高效的方式,適用于大多數場景。


7. 添加列:重置索引的影響

如果 Series 的索引與 DataFrame 不一致,直接賦值可能導致 NaN

s = pd.Series([10, 20, 30, 40], index=[0, 1, 2, 3])
df1['new_col'] = s  # 若 df1 索引為 [0,1,2,3],則正常;否則部分為 NaN

解決方案:

  • 使用 .values 強制忽略索引:
    df1['new_col'] = s.values  # 忽略索引,按順序賦值
    
  • 或先對齊索引:s.reindex(df1.index)

二、合并多個數據集(Merge & Join)

當數據集之間有共同鍵(key),但結構不同(如主表+屬性表),應使用 mergejoin

方法類型用途對齊方式默認連接類型
pd.concat()函數拼接多個對象(行/列)按索引對齊外連接(outer)
DataFrame.join()方法水平合并多個 DataFrame左表列/行索引 vs 右表行索引左連接(left)
pd.merge()函數靈活合并兩個 DataFrame基于列或索引內連接(inner)

1. pd.merge():最靈活的合并方式

left = pd.DataFrame({'key': ['K0', 'K1', 'K2'],'A': ['A0', 'A1', 'A2']
})right = pd.DataFrame({'key': ['K0', 'K1', 'K3'],'B': ['B0', 'B1', 'B3']
})# 基于列 'key' 合并
merged = pd.merge(left, right, on='key', how='inner')

參數詳解:

  • on:指定連接鍵(列名)
  • how:連接方式
    • 'inner':交集(默認)
    • 'outer':并集
    • 'left':保留左表所有行
    • 'right':保留右表所有行
  • left_on, right_on:左右表鍵名不同時使用
  • left_index=True, right_index=True:基于索引合并

示例:不同列名合并

pd.merge(left, right, left_on='key', right_on='key_r', how='outer')

2. DataFrame.join():基于索引的便捷合并

result = left.join(right.set_index('key'), on='key', how='left')
# 或者 right 的索引已經是 'key'
# result = left.join(right, on='key')

特點:

  • 默認以左表為基準how='left'
  • 通常用于:主表 + 多個屬性表(如公司信息 + 股價、行業等)
  • 支持多表連接:df.join([df2, df3, df4])

注意:join() 默認是左連接,而 merge() 默認是內連接


3. concat() vs merge() vs join() 對比總結

功能concat()merge()join()
是否支持多對象支持多個僅兩個支持多個
連接方向行或列僅列(水平)僅列(水平)
對齊依據索引列或索引左表列/索引 vs 右表索引
默認連接方式outerinnerleft
典型用途日志文件合并、時間序列拼接主鍵關聯表(如訂單+用戶)屬性擴展(如 ID + 特征)

三、常見實踐建議

推薦流程:

  1. 清理單個數據集 → 遵循整潔數據原則
  2. 統一列名與數據類型
  3. 根據關系選擇合并方式:
    • 結構相同 → pd.concat()
    • 有公共鍵 → pd.merge()df.join()
  4. 合并后檢查:
    • 行數是否合理?
    • 是否出現意外的 NaN
    • 索引是否需要重置?

常見錯誤避免:

  • 忘記 ignore_index=True 導致索引重復
  • 直接 concat(df, series) 而未包裝成 DataFrame
  • 使用已棄用的 .append()
  • merge 時未指定 on,導致笛卡爾積
  • 忽視 how 參數,丟失數據(如默認 inner 丟掉不匹配行)

四、總結

數據整合三劍客

1. pd.concat()
  • 用途:拼接多個對象(行/列)
  • axis=0: 上下拼(常用)
  • axis=1: 左右拼
  • ignore_index=True 重置索引
2. pd.merge()
  • 用途:基于列或索引合并兩個表
  • on=‘key’: 指定連接列
  • how: inner, outer, left, right
  • 最靈活,推薦用于主鍵關聯
3. df.join()
  • 用途:基于索引合并多個表
  • 默認左連接
  • 常用于主表 + 多個屬性表

Tip: 優先使用 concatmergejoin 適合索引對齊場景。


五、補充

1. 合并時處理重復列名(suffixes 參數)

當兩個 DataFrame 有相同列名但不是連接鍵時,mergejoin 會自動添加后綴避免沖突。

left = pd.DataFrame({'key': ['K0', 'K1'], 'value': [1, 2]})
right = pd.DataFrame({'key': ['K0', 'K1'], 'value': [3, 4]})merged = pd.merge(left, right, on='key', suffixes=('_left', '_right'))
print(merged)
# 輸出:
#   key  value_left  value_right
# 0  K0           1            3
# 1  K1           2            4

用途:比較同一指標在不同時間/來源的數據。

建議:始終顯式設置 suffixes,避免默認的 _x, _y 造成混淆。


2. 基于多列合并(復合鍵合并)

有時需要多個字段共同作為“主鍵”來合并。

pd.merge(df1, df2, on=['date', 'city', 'product_id'], how='inner')

典型場景

  • 按“日期+地區”合并天氣與銷售數據
  • 按“用戶ID+商品ID”合并評分與評論

注意:確保多列組合后能唯一標識一條記錄,否則可能產生笛卡爾積(行數暴增)。


3. 使用索引進行合并(left_index / right_index)

當數據以索引為唯一標識時(如時間序列、ID),可以直接用索引合并。

# 基于索引合并
result = pd.merge(df1, df2, left_index=True, right_index=True, how='outer')# 等價于:
result = df1.join(df2, how='outer')

優勢:避免創建冗余的 ID 列;適合時間對齊。

示例:對齊不同頻率的股票數據(日頻 + 周頻)


4. concat 的 join 參數:inner vs outer

pd.concat(..., axis=1) 默認是 outer(外連接),但可通過 join='inner' 只保留共有的行。

# 只保留所有表都存在的行
pd.concat([df1, df2, df3], axis=1, join='inner')# 保留所有行(默認)
pd.concat([df1, df2, df3], axis=1, join='outer')

用途

  • join='inner':嚴格對齊,避免 NaN
  • join='outer':保留全部信息,后續填充缺失值

5. 合并性能優化建議

場景建議
大數據集合并確保連接鍵是 categoryint 類型(比 object 快)
多次合并先合并小表,再與大表連接
時間序列拼接使用 pd.concat() + ignore_index=False 保持時間索引
內存不足考慮使用 daskpolars 替代

小技巧:合并前檢查數據類型:

print(df1['key'].dtype)
print(df2['key'].dtype)
# 確保類型一致,否則可能導致匹配失敗!

6. 合并后的質量檢查清單(QA)

每次合并后建議檢查以下幾點:

def check_merge_result(left, right, merged, how):print(f"左表行數: {len(left)}")print(f"右表行數: {len(right)}")print(f"合并后行數: {len(merged)}")if how == 'inner':assert len(merged) <= min(len(left), len(right))elif how == 'left':assert len(merged) >= len(left)elif how == 'right':assert len(merged) >= len(right)elif how == 'outer':assert len(merged) >= max(len(left), len(right))print(f"新增 NaN 數量: {merged.isna().sum().sum()}")

關鍵問題

  • 行數是否合理?
  • 是否出現大量 NaN?是否預期?
  • 索引是否重復或混亂?
  • 數據類型是否被意外轉換?

缺失值處理

為什么會出現缺失值?

在數據整合過程中,以下操作極易引入 NaN

  • pd.concat(..., axis=1) 拼接列時,行索引不完全對齊
  • pd.merge(..., how='left') 左連接時,右表無匹配記錄
  • join 擴展屬性時,某些 ID 沒有對應信息
  • 不同來源數據字段覆蓋不全

Pandas 使用 NaN(Not a Number)表示浮點型缺失值,None 表示對象型缺失值,兩者在大部分操作中被視為等價。


一、識別缺失值

1. 檢查缺失情況

# 查看每個字段缺失數量
df.isnull().sum()# 查看整體缺失比例
df.isnull().mean() * 100# 查看是否有任意缺失
df.isnull().any().any()# 可視化缺失模式(需 seaborn)
import seaborn as sns
sns.heatmap(df.isnull(), cbar=True, yticklabels=False, cmap='viridis')

建議:在每次合并后立即檢查缺失情況


二、缺失值的產生場景與應對策略

整合操作缺失原因建議處理方式
concat(axis=0)不同文件字段不一致統一列名 / 補充默認值
concat(axis=1)行索引不對齊對齊索引 / 使用 join='inner'
merge(how='left')右表無匹配鍵檢查數據完整性 / 改用 outer
join()某些 ID 無擴展信息補充默認屬性 / 標記為“未知”

三、處理缺失值的常用方法

1. 刪除缺失值(dropna

適用于:缺失嚴重且無法填補,或樣本足夠多。

# 刪除任意含缺失的行
df.dropna(axis=0, how='any')# 刪除所有值都缺失的列
df.dropna(axis=1, how='all')# 只在關鍵列缺失時刪除
df.dropna(subset=['user_id', 'order_date'])

風險:可能導致樣本偏差或信息丟失。


2. 填充缺失值(fillna

(1)填充固定值
df['category'] = df['category'].fillna('Unknown')
df['price'] = df['price'].fillna(0)
(2)前向/后向填充(適合時間序列)
df['value'] = df['value'].fillna(method='ffill')  # 用前一個值填充
df['value'] = df['value'].fillna(method='bfill')  # 用后一個值填充

method 參數已棄用,推薦使用 ffill / bfill 方法:

df['value'] = df['value'].ffill()
(3)用統計量填充
# 數值型:均值、中位數
df['age'] = df['age'].fillna(df['age'].mean())
df['income'] = df['income'].fillna(df['income'].median())# 分類型:眾數
mode_value = df['gender'].mode()[0]  # 取第一個眾數
df['gender'] = df['gender'].fillna(mode_value)
(4)用模型預測填充(高級)
from sklearn.impute import KNNImputer
imputer = KNNImputer(n_neighbors=5)
df[['age', 'income']] = imputer.fit_transform(df[['age', 'income']])

3. 插值法填充(interpolate

適用于:時間序列或有序數據。

# 線性插值
df['value'] = df['value'].interpolate(method='linear')# 時間序列插值(考慮時間間隔)
df['value'] = df.set_index('date')['value'].interpolate(method='time').values# 多項式插值(更平滑)
df['value'] = df['value'].interpolate(method='polynomial', order=2)

4. 標記缺失(創建指示變量)

有時“是否缺失”本身就是一個重要特征。

# 創建缺失標志列
df['age_missing'] = df['age'].isnull().astype(int)
df['price_missing'] = df['price'].isnull().astype(int)

用途:在機器學習中作為額外特征,幫助模型理解數據質量。


四、結合數據整合的完整流程示例

# 示例:合并用戶信息與訂單數據
users = pd.read_csv('users.csv')   # 包含 user_id, age, city
orders = pd.read_csv('orders.csv') # 包含 order_id, user_id, amount# 步驟1:合并
merged = pd.merge(orders, users, on='user_id', how='left')# 步驟2:檢查缺失
print("合并后缺失情況:")
print(merged.isnull().sum())# 步驟3:處理缺失
merged['city'] = merged['city'].fillna('Unknown')
merged['age'] = merged['age'].fillna(merged['age'].median())# 步驟4:標記缺失(可選)
merged['age_was_missing'] = (merged['age'] == merged['age'].median()).astype(int)# 步驟5:驗證
assert merged.isnull().sum().sum() == 0  # 確保無缺失

五、缺失值處理策略選擇指南

場景推薦方法
缺失率 < 5%可考慮刪除行
數值型變量均值/中位數填充,或插值
分類型變量眾數填充,或新增“Unknown”類別
時間序列前向填充、時間插值
關鍵字段無匹配檢查數據源,避免錯誤合并
機器學習建模結合 fillna + 缺失標志列

六、最佳實踐建議

黃金法則

“寧可標記,也不要隨意刪除或填充。”

推薦流程

  1. 合并前:統一字段、數據類型、索引
  2. 合并后:立即檢查缺失分布
  3. 分析缺失機制
    • MCAR(完全隨機缺失)
    • MAR(隨機缺失)
    • MNAR(非隨機缺失)
  4. 選擇合適策略:根據業務邏輯決定如何處理
  5. 記錄處理過程:便于復現和審計

七、缺失值處理速查表

檢查

  • df.isnull().sum() → 查看各列缺失數
  • df.isnull().mean() → 查看缺失比例

刪除

  • df.dropna() → 刪除含缺失的行
  • df.dropna(subset=['col']) → 指定列刪除

填充

  • df['col'].fillna(0) → 填固定值
  • df['col'].fillna(df['col'].mean()) → 填均值
  • df['col'].ffill() → 前向填充
  • df['col'].interpolate() → 插值

標記

  • df['col_missing'] = df['col'].isnull().astype(int)

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