國自然面上項目|基于多模態MR影像的膠質母細胞瘤高危區域定位及預后預測研究|基金申請·25-02-28

小羅碎碎念

今天和大家分享一個面上項目,執行年限為2019.01~2022.12,直接費用為57萬元。

膠質母細胞瘤(GBM)預后差且差異大,異質性是重要因素,臨床手段難評價。影像組學為異質性研究提供方法,MR 影像紋理特征可評價 GBM 異質性,但現有研究多針對整個腫瘤區域,難以評估不同區域預后特性,影響預后預測準確性。

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基于 GBM 患者多模態 MR 影像,開展三方面工作:

  1. 結合多模 MR 影像和 GBM 多個區域,提取特征構建患者生存分層諾模圖
  2. 提出多模態影像腫瘤異質性分割和多示例學習的弱監督學習算法,挖掘高危子區域并構建生存分層模型;
  3. 提出 SHNet 模型,解決深度學習模型可視化定位不準問題,對膠質瘤分級進行預測

通過本項目研究,建立了腫瘤異質性分割、高危區域定位和深度可視化方法,能為 GBM 診斷及手術定位等提供定量信息,具有重要臨床意義。


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一、項目簡介

異質性是造成膠質母細胞瘤(GBM)預后差且差異大的重要因素,臨床手段難評價異質性,影像組學提供了研究方法,MR影像紋理特征可評價GBM異質性。但現有研究多針對整個腫瘤區域,難以評估不同區域預后特性,影響預后預測準確性。

為此,本項目提出基于多模態MR影像的異質性分析及預后預測方法:

  • 1)用層次聚類方法將GBM內異質性的腫瘤實質區域分割為多個同質子區域;
  • 2)以預后作為子區域危險程度評價標準,用多事件學習方法判斷子區域危險特性,定位高危區域,實現異質性分析;
  • 3)篩選能反映子區域預后特性的影像學標記,建立基于異質性分析的GBM預后預測模型。

研究結果可為GBM診斷及手術定位等提供定量信息,具有重要臨床意義 。


二、膠質母細胞瘤患者影像異質性子區域的劃分過程

左側展示了原始的 MR 影像,包括 FLAIR、T1、T2、T1C 序列。

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上方是通過T1C和FLAIR影像劃分出四個異質性子區域:

  • ① r - EA
  • ② r - CE
  • ③ r - Nec
  • ④ r - E/nCE

下方中間部分顯示對T1C影像進行小波變換(Wavelet Transform),得到四個小波圖像,分別是LL of T1C、LH of T1C、HL of T1C、HH of T1C 。

該示意圖用于展示如何基于多模態MR影像對GBM腫瘤進行異質性子區域劃分及影像處理的過程 。


三、基于K - means的瘤內異質分割模式

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  1. 針對多個患者的腫瘤影像(圖中左側多個帶紅圈的圖像),分別將其四種模態像素強度值量化為像素矩陣(如像素矩陣1、2 直至n)。
  2. 將所有患者像素點整合形成超級像素矩陣。
  3. 運用K - means算法對超級像素矩陣進行聚類,得到不同的聚類簇(類別1、類別2、類別3)。
  4. 最后通過映射,將聚類結果對應到不同的腫瘤子區域(R1、R2、R3)。該模式用于對腫瘤內部的異質性進行分割分析。

四、傳統方法和本項目方法在處理醫學影像方面的差異

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  • 傳統框架:先對影像進行分類(Classification),得到一個結果(result),之后再進行可視化解釋(Visual explanation),是分步進行的。
  • 本文框架:將影像劃分子區域(subregions),在處理過程中同時生成可視化解釋(visual explanation)和分類結果(result) ,實現了兩者的同步進行。右側的一系列腦部影像展示了從低級(Low level)到高級(High level)的處理結果,可能用于體現不同方法的效果差異。

結束語

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