表型數據處理
? 質量性狀
– 二分類:可用0 / 1, 1 / 2 數值表示
– 多分類:啞變量賦值,0/1
? 數量性狀
– 盡量符合正太分布
– 剔除異常表型值樣本
– 多年多點重復觀測
– 對于閾值性狀,分級數量化或啞變量賦值
R中 shapiro.test檢測正態性
正態性轉換
? Box-cox變換
? Rank-base inverse-normal
transformation( INV) C=0.5
是否需要INV轉換
多年多點
? 分別分析
? 均值
? BLUP: Best Linear Unbiased Predictor
? BLUE: Best Linear Unbiased Estimator
重測序-Resequencing
定義
對基因組序列已知物種的個體進行基因組測序,并在此基礎上對個體或群體進行差異性分析。