psRoto軟件安裝
- 網址
http://omicslab.genetics.ac.cn/psRobot/downloads.php
- 下載和安裝
wget http://omicslab.genetics.ac.cn/psRobot/program/WebServer/psRobot_v1.2.tar.gz
#
tar -zxvf psRobot_v1.2.tar.gz
#
cd psRobot_v1.2
##
./configure
make
make install
psRoto中的4個程序
- psRobot_map
psRobot_map 用于在較長的參考序列中找到短序列(小于 40bp)的所有完美匹配位置;
- psRobot_mir
psRobot_mir旨在從高通量測序數據中為一批輸入序列尋找具有莖環前體的小RNA(如miRNA或shRNA)
- psRobot_tar
psRobot_tar 用于尋找潛在的小 RNA 靶標
- psRobot_deg
psRobot_deg 用于識別用戶指定的退化組數據支持哪些小 RNA 靶點
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