轉錄組分析流程(三):功能富集分析

我們的教程主要是以一個具體的例子作為線索,通過對公共數據庫數據bulk-RNA-seq的挖掘,利用生物信息學分析來探索目標基因集作為某種疾病數據預后基因的潛能及其潛在分子機制,同時在單細胞水平分析(對scRNA-seq進行挖掘)預后基因的表達,了解細胞之間的通訊網絡,以期為該疾病臨床治療提供新的參考,同時我們還可以經過分子對接實現藥物靶點的初步篩選。

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文章目錄

    • 一、背景
      • 1. 功能富集分析的必要性
      • 2. GO與KEGG數據庫的區別
      • 3. PPI網絡分析的補充作用
    • 二、功能富集分析實戰
        • 1.GO/KEGG分析
        • 2.PPI分析

一、背景

1. 功能富集分析的必要性

  • 差異基因的解讀需求:高通量測序(如RNA-seq)通常會產生大量差異表達基因(DEGs),但這些基因

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