書接上回，使用 Obsidian, Zotero, JabRef, Pandoc, Markup-Markdown | 撰寫論文 paper

TL; DR

安裝 pandoc v3.6.2. 使用一下命令，將 markdown 轉化為論文的 word 文件。

pandoc --from markdown+footnotes+citations \--wrap=none \--reference-doc=../styles/project_paper.docx \--csl=refs/diabetologia.csl \--citeproc \--bibliography=manual_20250203.yaml \--bibliography=refs.yaml \-i index.md -o index.docx

命令解釋：

• markdown+footnotes+citations: 設置pandoc 的插件
• reference-doc：論文的格式
• csl：引用參考文獻的語法；diabetologia.csl 在 https://www.zotero.org/styles?q=diabetologia 下載
• citeproc：明確使用哪個插件處理交叉引用
• bibliography：參考文獻的索引文件，bibliography 文獻管理可以通過 zotero 自動導出或 JabRef 手動維護；支持添加多個 bibliography。

如果在 Markdown 中，使用了

[@Hinton2006] [@Krizhevsky2017]
...# References

那么，對應的生成的 docx 就會包含(轉化后的文本)：

以及參考文獻內容：

注意：Markdown 文件的最后一行必須是 # References，否則將不生成參考文獻列表，見官方文檔。

導出 bibliography 文件

導出 bibliography 文件的格式使用：CSL YAML. 比如 JabRef 中，通過 File -> Export 進行導出。

注意：不要直接改 CSL YAML 文件，而是使用 JabRef 或 Zotero 進行維護，因為 JabRef 或 Zotero 不能直接打開 CSL YAML 文件。

JabRef

Zotero

Zotero 導出如下，選擇一個 Collection 右鍵 -> Export Collection, 選擇 Better CSL YAML(需要安裝插件 Better BibTeX for Zotero).

參考文獻引用語法

在 Markdown 中使用 CitationKey，生成參考文獻引用，對應格式如下：

除了使用 [] 的形式添加引用，也可以用文本的形式：

reference-doc

reference-doc 就是樣式文件，比如生成 docx 的大標題、二級標題、行間距、正文字體等。

最快的獲得一個 reference-doc 模版的方法，就是先用 pandoc 將一個 markdown 轉化為 docx 文件，然后以這個文件為藍本，更新頁眉、頁腳、headings。

更多關于 reference-doc 的介紹，參考官方文檔。

Links

Scholarly Writing Citations

zotero csl styles

Bibliographies 以及 Citations

Citations of Pandoc