Conda跨平臺環境遷移

問題描述:

在一臺Ubuntu電腦上完全復刻在Windows中通過conda創建的環境。

導出環境

在Windows機器上,需要導出當前conda環境的配置。這將生成一個environment.yml文件,其中包含所有已安裝的包和版本信息。

打開Anaconda Prompt(或任何你使用的命令行界面),然后運行以下命令來導出環境:

conda env export --name <env_name> > environment.yml

這里 <env_name> 是在Windows上創建的conda環境的名字。

復制 environment.yml 文件

將生成的environment.yml文件復制到目標ubuntu機器上。可以使用USB驅動器、網絡共享或者通過SSH傳輸文件。

在Ubuntu上安裝conda

如果ubuntu上還沒有安裝Miniconda,需要先安裝,可以從Miniconda的官方網頁下載適合Linux的安裝腳本,或者從清華鏡像等其他可信的鏡像站點下載。然后運行安裝腳本并按照提示操作。

創建新環境

在Ubuntu上,使用environment.yml文件來創建與Windows上相同的環境。在終端中運行以下命令:

conda env create -f environment.yml

這將讀取environment.yml文件并創建一個具有相同包和版本的新環境。

激活新環境

創建完環境后,你需要激活它才能開始使用:

conda activate <new_env_name>

這里 <new_env_name> 是在Ubuntu上創建的環境名字,通常這會和Windows上的環境名字相同。

注意事項

  • 確保在兩臺機器上使用的Miniconda版本盡量一致,以避免潛在的兼容性問題。

  • 某些包可能在不同的操作系統上有不同的構建,因此在Ubuntu上創建環境時可能會遇到一些差異或錯誤。如果出現這種情況,需要手動解決這些依賴關系。如下:

    • (base) root@xxxxxxxxxxxxxxxxx:~/Desktop# conda env create -f environment.yml
      Collecting package metadata (repodata.json): done
      Solving environment: failedResolvePackageNotFound:certifi==2021.5.30=py36haa95532_0
      vc==14.2=h2eaa2aa_1
      pip==21.2.2=py36haa95532_0
      setuptools==58.0.4=py36haa95532_0
      vs2015_runtime==14.29.30133=h43f2093_3
      python==3.6.13=h3758d61_0
      wincertstore==0.2=py36h7fe50ca_0
      sqlite==3.45.3=h2bbff1b_0
      
      • 修改 environment.yml 文件

        打開environment.yml文件,移除所有只在Windows上存在的包和版本號,例如vc, vs2015_runtime等。同時,對于Python和其他基礎庫,如sqlite,確保它們沒有特定于Windows的構建標簽。

        原本的條目可能類似于:

        dependencies:- python=3.6.13=h3758d61_0- sqlite=3.45.3=h2bbff1b_0
        

        應該修改為:

        dependencies:- python=3.6- sqlite
        

        這樣Conda將在解決依賴關系時選擇適用于Linux的默認構建。

        添加 Linux 兼容的包

        對于像certifipipsetuptoolswincertstore這樣的包,確保它們沒有Windows特有的構建標簽。在environment.yml文件中,只需要指定包名即可,例如:

        dependencies:- certifi- pip- setuptools
        

        嘗試再次創建環境

        保存并關閉environment.yml文件。再次運行:

        conda env create -f environment.yml
        

        如果仍有包無法找到,檢查它們是否真的有Linux版本,或者是否有替代的包可以滿足相同的功能需求。

  • 如果environment.yml文件中的某些包在Ubuntu上不可用,需要找到合適的替代品或者從源代碼編譯。

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