Linux系統時間不對導致mysql初始化失敗：Data Dictionary initialization failed.（數據字典版本驗證失敗）

文章目錄

  • 問題描述
  • 分析
    • **問題原因分析**
    • **解決方案**
      • **1. 修正系統時間**
      • **2. 檢查數據目錄完整性**
      • **3. 重新初始化數據目錄**
      • **4. 調整 MySQL 配置**
    • **驗證與后續步驟**
    • **注意事項**
  • 其他說明

問題描述

mysql數據初始化失敗，發現系統時間是1970年，我將系統時間改成2025年，就能初始化成功了。

1970-01-01T01:44:08.999267Z 0 [System] [MY-010910] [Server] /usr/sbin/mysqld: Shutdown complete (mysqld 8.0.33)  MySQL Community Server - GPL.
1970-01-01 09:45:01+08:00 [Note] [Entrypoint]: Entrypoint script for MySQL Server 8.0.33-1.el8 started.
1970-01-01 09:45:01+08:00 [Note] [Entrypoint]: Switching to dedicated user 'mysql'
1970-01-01 09:45:01+08:00 [Note] [Entrypoint]: Entrypoint script for MySQL Server 8.0.33-1.el8 started.
'/var/lib/mysql/mysql.sock' -> '/var/run/mysqld/mysqld.sock'
mysqld: [Warning] World-writable config file '/etc/mysql/conf.d/mysqld.cnf' is ignored.
1970-01-01T01:45:03.045951Z 0 [Warning] [MY-011068] [Server] The syntax '--skip-host-cache' is deprecated and will be removed in a future release. Please use SET GLOBAL host_cache_size=0 instead.
1970-01-01T01:45:03.049185Z 0 [System] [MY-010116] [Server] /usr/sbin/mysqld (mysqld 8.0.33) starting as process 1
1970-01-01T01:45:03.053492Z 0 [Warning] [MY-013242] [Server] --character-set-server: 'utf8' is currently an alias for the character set UTF8MB3, but will be an alias for UTF8MB4 in a future release. Please consider using UTF8MB4 in order to be unambiguous.
1970-01-01T01:45:03.053523Z 0 [Warning] [MY-013244] [Server] --collation-server: 'utf8mb3_general_ci' is a collation of the deprecated character set UTF8MB3. Please consider using UTF8MB4 with an appropriate collation instead.
1970-01-01T01:45:03.074083Z 1 [System] [MY-013576] [InnoDB] InnoDB initialization has started.
1970-01-01T01:45:03.338899Z 1 [System] [MY-013577] [InnoDB] InnoDB initialization has ended.
1970-01-01T01:45:03.348297Z 1 [ERROR] [MY-011096] [Server] No data dictionary version number found.
1970-01-01T01:45:03.348883Z 0 [ERROR] [MY-010020] [Server] Data Dictionary initialization failed.
1970-01-01T01:45:03.349101Z 0 [ERROR] [MY-010119] [Server] Aborting
1970-01-01T01:45:03.949729Z 0 [System] [MY-010910] [Server] /usr/sbin/mysqld: Shutdown complete (mysqld 8.0.33)  MySQL Community Server - GPL.
1970-01-01 09:46:04+08:00 [Note] [Entrypoint]: Entrypoint script for MySQL Server 8.0.33-1.el8 started.
1970-01-01 09:46:05+08:00 [Note] [Entrypoint]: Switching to dedicated user 'mysql'
1970-01-01 09:46:05+08:00 [Note] [Entrypoint]: Entrypoint script for MySQL Server 8.0.33-1.el8 started.
'/var/lib/mysql/mysql.sock' -> '/var/run/mysqld/mysqld.sock'
mysqld: [Warning] World-writable config file '/etc/mysql/conf.d/mysqld.cnf' is ignored.
1970-01-01T01:46:06.744074Z 0 [Warning] [MY-011068] [Server] The syntax '--skip-host-cache' is deprecated and will be removed in a future release. Please use SET GLOBAL host_cache_size=0 instead.
1970-01-01T01:46:06.747196Z 0 [System] [MY-010116] [Server] /usr/sbin/mysqld (mysqld 8.0.33) starting as process 1
1970-01-01T01:46:06.751486Z 0 [Warning] [MY-013242] [Server] --character-set-server: 'utf8' is currently an alias for the character set UTF8MB3, but will be an alias for UTF8MB4 in a future release. Please consider using UTF8MB4 in order to be unambiguous.
1970-01-01T01:46:06.751518Z 0 [Warning] [MY-013244] [Server] --collation-server: 'utf8mb3_general_ci' is a collation of the deprecated character set UTF8MB3. Please consider using UTF8MB4 with an appropriate collation instead.
1970-01-01T01:46:06.771748Z 1 [System] [MY-013576] [InnoDB] InnoDB initialization has started.
1970-01-01T01:46:07.034656Z 1 [System] [MY-013577] [InnoDB] InnoDB initialization has ended.
1970-01-01T01:46:07.044106Z 1 [ERROR] [MY-011096] [Server] No data dictionary version number found.
1970-01-01T01:46:07.044737Z 0 [ERROR] [MY-010020] [Server] Data Dictionary initialization failed.
1970-01-01T01:46:07.044811Z 0 [ERROR] [MY-010119] [Server] Aborting
1970-01-01T01:46:07.644094Z 0 [System] [MY-010910] [Server] /usr/sbin/mysqld: Shutdown complete (mysqld 8.0.33)  MySQL Community Server - GPL.

1970-01-01T01:46:06.771748Z 1 [System] [MY-013576] [InnoDB] InnoDB initialization has started.
1970-01-01T01:46:07.034656Z 1 [System] [MY-013577] [InnoDB] InnoDB initialization has ended.
1970-01-01T01:46:07.044106Z 1 [ERROR] [MY-011096] [Server] No data dictionary version number found.
1970-01-01T01:46:07.044737Z 0 [ERROR] [MY-010020] [Server] Data Dictionary initialization failed.
1970-01-01T01:46:07.044811Z 0 [ERROR] [MY-010119] [Server] Aborting

分析

根據你提供的日志和描述，系統時間錯誤確實可能導致 MySQL 初始化失敗。以下是詳細分析和解決方案：

問題原因分析

  1. 系統時間錯誤：

    • 日志中顯示的時間戳為 1970-01-01（Unix 時間起點），表明系統時間未正確配置。MySQL 在初始化時會依賴系統時間進行以下操作：
      • 數據字典版本驗證：MySQL 8.0 引入了新的數據字典（Data Dictionary），其元數據包含版本信息。如果系統時間錯誤（如設置為 1970 年），MySQL 可能無法正確解析這些信息，導致 No data dictionary version number found 錯誤。
      • 文件時間戳一致性：MySQL 初始化時會檢查數據目錄中文件的時間戳。若系統時間錯誤，可能導致 MySQL 認為文件時間早于預期，從而觸發初始化失敗。

  2. 配置或數據損壞：

    • 如果系統時間錯誤導致 MySQL 無法正確讀取數據目錄中的文件（如 ibdata1、ib_logfile* 等），可能引發數據字典初始化失敗。即使系統時間修正后，仍需檢查數據目錄是否損壞。

解決方案

1. 修正系統時間

  • 臨時修改（僅用于測試）：
    # 設置正確的時間和時區
sudo date -s "2025-06-20 15:35:00"
sudo timedatectl set-timezone Asia/Shanghai
  • 永久同步時間（推薦）：
    安裝并啟用 NTP 服務，確保系統時間自動同步：
    # 安裝 NTP
sudo apt install ntp  # Debian/Ubuntu
sudo yum install ntp  # CentOS/RHEL# 啟動并啟用 NTP 服務
sudo systemctl enable ntp --now

2. 檢查數據目錄完整性

  • 手動檢查數據目錄：
    確保 MySQL 數據目錄（通常是 /var/lib/mysql）權限和文件完整性：

    sudo chown -R mysql:mysql /var/lib/mysql
sudo chmod -R 750 /var/lib/mysql

  • 修復數據文件：
    如果數據目錄損壞，可以嘗試使用 mysqlcheck 工具修復：

    sudo mysqlcheck --all-databases --check-upgrade --auto-repair -u root -p

3. 重新初始化數據目錄

如果上述方法無效，可能需要重新初始化數據目錄：

  1. 備份現有數據（如有必要）：

    sudo cp -r /var/lib/mysql /var/lib/mysql_backup

  2. 刪除舊數據目錄：

    sudo rm -rf /var/lib/mysql/*

  3. 重新初始化：

    sudo mysqld --initialize --user=mysql

  4. 啟動 MySQL：

    sudo systemctl start mysql

4. 調整 MySQL 配置

  • 避免使用過時的字符集配置：
    日志中提示 utf8 將在未來版本中映射到 utf8mb4。更新 my.cnf 配置文件：

    [mysqld]
character-set-server = utf8mb4
collation-server = utf8mb4_unicode_ci

  • 移除廢棄參數：
    日志中提示 --skip-host-cache 已棄用，替換為：

    SET GLOBAL host_cache_size = 0;

驗證與后續步驟

  1. 檢查 MySQL 日志：
    查看 /var/log/mysql/error.log 或 /var/log/mysqld.log，確認是否仍有錯誤。

  2. 測試數據庫連接：

    mysql -u root -p -e "SHOW DATABASES;"

  3. 監控系統時間：
    使用 ntpstat 或 timedatectl 確保系統時間同步：

    timedatectl

注意事項

  • 避免手動修改系統時間：長期依賴手動修改時間可能導致其他服務異常（如證書驗證失敗、日志混亂等）。務必使用 NTP 自動同步。
  • 備份數據：在重新初始化數據目錄前，務必備份重要數據。
  • 升級 MySQL：如果你使用的是較舊版本（如 8.0.33），建議升級到最新版本以修復潛在問題。

如果問題仍未解決，請提供完整的 MySQL 錯誤日志和 my.cnf 配置文件內容，以便進一步排查。

其他說明

上海107 ubuntu22.04 算能盒子硬件時鐘是有電的，能夠取得時間，但是初始時間未設置，為1970年，導致mysql數據初始化時失敗。

猜測之前的英偉達盒子，可能系統啟動的時候做了個判斷，如果硬件時間是1970年附近，就把硬件時鐘設置為2023年2月，所以一直沒問題。

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