腦影像分析軟件推薦 | JuSpace

目錄

1. 軟件界面

2.工具包功能簡介

3.軟件安裝注意事項


參考文獻

Dukart J, Holiga S, Rullmann M, Lanzenberger R, Hawkins PCT, Mehta MA, Hesse S, Barthel H, Sabri O, Jech R, Eickhoff SB. JuSpace: A tool for spatial correlation analyses of magnetic resonance imaging data with nuclear imaging derived neurotransmitter maps. Hum Brain Mapp. 2021 Feb 15;42(3):555-566. doi: 10.1002/hbm.25244. Epub 2020 Oct 20.

1. 軟件界面

圖片

2.工具包功能簡介

JuSpace是一種允許基于?MRI 測量與核成像衍生估計的跨模態關聯的工具包,它涵蓋各種神經遞質系統,包括多巴胺能、血清素能、去甲腎上腺素能和 GABA(γ-氨基丁酸) 神經傳遞。JuSpace 由一組 Matlab 功能以及涵蓋各種受體系統的 PET 受體圖譜組成。

1.數據選擇:用戶需要選擇MRI數據,能夠與提供的PET和SPECT圖相關聯

a)單一模式的數據(“files 1” only)

b)用于在不同條件間對比的數據?(“files 1” and “files 2”, i.e., patients vs. healthy controls or pre- vs. posttreatment data)

2.計算computing

a)組之間的效應大小(計算列表?1 和列表 2 中所選文件之間每個圖集區域的 Cohen's d)

b)成對差異的效應大小(計算列表?1 中文件相對于列表 2 之間的成對差異的 Cohen d)

c)列表?1 中的平均值(計算列表 1 中所有文件的每個圖集區域的平均值)

d)每個圖像列出?1(從列表 1 中提取每個文件的每個圖集區域的平均值)

e)計算列表?1 中每個文件相對于列表 2 的單個 z score映射

f)計算列表?1 和列表 2 之間的成對差值

g)計算列表?1 中每個文件相對于列表 1 中其他文件的留一法 z score映射

h)從列表?1 中提取每個文件的每個圖集區域的平均值,并將所有圖像的相關系數與零分布進行比較

2.選擇分析類型(Pearson 相關、Spearman 相關或多元線性回歸)

3.軟件安裝注意事項

JuSpace是Matlab環境下運行的軟件包(2017b之后的版本),使用時需要安裝?SPM12。它還可以在安裝了 Matlab 包和 Stats 工具箱的任何其他操作系統上使用,如 Unix 或 Linux。

1、下載并安裝SPM12

2、確保已將SPM12添加到Matlab路徑

3、下載最新版本的 JuSpace,將解壓的文件夾添加到目錄中;

4、將當前目錄轉到JuSpace文件夾

5、鍵入“JuSpace”顯示用戶界面

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