R --- Error in library(***) : there is no package called ‘***’ (服務器非root用戶)

步驟

      • 步驟一:在自己目錄下創建R包安裝路徑
      • 步驟二:配置用戶本地的R庫路徑
      • 步驟三:安裝缺失的包(在終端)
      • 步驟四:驗證安裝

步驟一:在自己目錄下創建R包安裝路徑

mkdir -p ~/R_libs

步驟二:配置用戶本地的R庫路徑

在家目錄下,編輯(或新建).Renviron文件:

vim ~/.Renviron

在文件內寫入如下內容: R_LIBS_USER=~/R_libs,保存后退出。

步驟三:安裝缺失的包(在終端)

在終端運行:

module add apps/R/4.3.2
module add compiler/gnu/8.3.0_fortranR

進入R后,執行:

install.packages('mice', repos='http://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/CRAN')
install.packages('lme4', repos='http://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/CRAN')
install.packages('lmerTest', repos='http://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/CRAN')
install.packages('piecewiseSEM', repos='http://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/CRAN')
install.packages('openxlsx', repos='http://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/CRAN')
install.packages('dplyr', repos='http://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/CRAN')
install.packages('ggplot2', repos='http://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/CRAN')
install.packages('DiagrammeR', repos='http://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/CRAN')
install.packages('sjPlot', repos='http://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/CRAN')

步驟四:驗證安裝

退出R:

quit()

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