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文章目錄
- 介紹
- 差異分析(limma)
- KEGG富集分析(enrichKEGG)
- 可視化
- 加載R包
- 數據下載
- 導入數據
- 基因差異分析
- 火山圖
- KEGG通路富集分析
- 可視化通路結果
- 另一個案例
- 總結
- 系統信息
- 參考
介紹
KEGG富集分析,可以發現差異基因所涉及的生物學通路,從而深入了解在特定生物學過程中起關鍵作用的分子機制。例如,在疾病發生發展過程中,哪些代謝通路或信號通路發生了改變,有助于揭示疾病的發病機制。
富集分析結果可以為后續的實驗研究提供方向和依據。研究人員可以根據富集的通路選擇相關的基因或通路進行深入的功能驗證實驗,如基因敲除、過表達等,進一步探索其在生物學過程中的具體作用。
在疾病相關的轉錄組研究中,KEGG富集分析有助于發現與疾病發生發展密切相關的通路和基因,這些通路和基因可能成為潛在的治療靶點,為藥物研發和治療策略的制定提供參考。通過對比不同樣本或處理組間的KEGG富集結果,可以直觀地了解它們在生物學通路層面的差異,有助于理解不同因素對生物系統的影響。
差異分析(limma)
- 原理:limma(linear models fo